* دانشکده‌ها

دانشکده پزشکی
دانشکده دندانپزشکی
دانشکده داروسازی
دانشکدهٔ پیراپزشکی
دانشکدهٔ بهداشت
دانشکدهٔ پرستاری و مامایی
دانشکدهٔ علوم پزشکی میبد
دانشکدهٔ مجازی
دانشکدهٔ پیراپزشکی ابرکوه
دانشکدهٔ طب سنتی اردکان

* بیمارستان‌ها

بیمارستان شهید آیت‌الله بهشتی تفت
بیمارستان امام جعفر صادق میبد
بیمارستان ضیایی اردکان
بیمارستان فاطمه الزهرا مهریز
بیمارستان آیت‌الله خاتمی خاتم
بیمارستان ولیعصر بافق
بیمارستان خاتم‌الانبیاء ابرکوه
سوانح و سوختگی شهید صدوقی یزد
بیمارستان شهید صدوقی یزد
بیمارستان شهید دکتر رهنمون
بیمارستان محمد صادق افشار یزد
بیمارستان روانپزشکی استان یزد

* مراکز تحقیقاتی

پژوهشکدهٔ علوم تولید مثل
مرکز تحقیقاتی گیاهان دارویی
مرکز تحقیقاتی رفتارهای بهداشتی
مرکز تحقیقاتی سیاست‌گذاری سلامت
مرکز تحقیقاتی مدیریت بیمارستانی
مرکز تحقیقاتی بیماری‌های بینی و سینوس
مرکز تحقیقاتی بیماری‌های ناشی از صنعت
مرکز تحقیقاتی خون و سرطان
مرکز تحقیقاتی دیابت
مرکز تحقیقاتی پرتو درمانی
مرکز تحقیقاتی علوم و فناوری‌های محیط زیست
مرکز تحقیقاتی قلب و عروق
مرکز تحقیقاتی بیماری‌های عفونی و گرمسیری
مرکز تحقیقاتی تروما
مرکز تحقیقاتی زیست پزشکی اعصاب
مرکز تحقیقاتی اختلالات رشد کودکان
مرکز تحقیقاتی ایمنی و بهداشت محیط کار
مرکز تحقیقاتی تشخیص مولکولی مخاطرات مواد غذایی